在口腔醫學領域，臭氧治療儀也有著獨特的應用。在牙周病治療中，臭氧可以有效殺滅牙周袋內的厭氧菌，如牙齦卟啉單胞菌等，減少細菌毒素對牙周組織的破壞，促進牙周組織的愈合。它還能抑制炎癥反應，減輕牙齦紅腫、出血等癥狀，改善牙周健康狀況。

對于口腔潰瘍患者，臭氧的局部應用可以促進潰瘍面的愈合，減輕疼痛。其氧化作用能夠清潔潰瘍表面，殺滅表面的病原體，同時刺激口腔黏膜細胞的再生。但由于口腔環境特殊，使用臭氧治療儀時需要精確控制臭氧的濃度和作用時間，防止對口腔正常組織造成不必要的損傷，并且要遵循嚴格的消毒和操作規范。